CDS

Accession Number TCMCG081C19867
gbkey CDS
Protein Id XP_019078527.1
Location 2002065..2005082
Gene LOC100249195
GeneID 100249195
Organism Vitis vinifera

Protein

Length 1005aa
Molecule type protein
Topology linear
Data_file_division PLN
dblink BioProject:PRJNA33471
db_source XM_019222982.1
Definition PREDICTED: pentatricopeptide repeat-containing protein At3g24000, mitochondrial [Vitis vinifera]

EGGNOG-MAPPER Annotation

COG_category S
Description Pentatricopeptide repeat-containing protein
KEGG_TC 3.A.2.1
KEGG_Module M00158        [VIEW IN KEGG]
KEGG_Reaction -
KEGG_rclass -
BRITE ko00000        [VIEW IN KEGG]
ko00001        [VIEW IN KEGG]
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KEGG_ko ko:K02140        [VIEW IN KEGG]
EC -
KEGG_Pathway ko00190        [VIEW IN KEGG]
ko01100        [VIEW IN KEGG]
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GOs -

Sequence

CDS:  
ATGGAATGCGATTGCTTTTCTTTGAGAATGCGCAGTCCACCCCCTAGTTTTCGAGGGATATTCTTCTTGCCGAGCTGCCCGATACAGTCTCCTTCGCTTAAATTCTTCAAGAAACCTCAAACAATCTCCAGAAATTTTCAGTTTTCTATTCGGTTGAAATCTTTGTCTTGTGCTCTCGATGCTATTGAGTCAAACCCTACAGGCCATTGGGCTTTCGGCGATGCCCAGAACTTGCCGGTTCGGCTTCAGGATGGGTTCCAGAAAACGCCCAGTAAACTGTCGAGTCCCAATAGACCCAATTCGACGCCGGGGAATAAGATTCCTGAAACAGTTGAAAAGAAGAGAATTTGGAGGGGTTTGGATTTTGATAGCAAGGGGAGGCTAAGACAGTATTCGGGGATGCTGAGGACTTGTGCTTCAAAAGGGGATTTAAATGAAGGGAAGGCCATTCATGGGCAGGTGATAAAAAGTGGGATAAACCCGGATTCCCATTTGTGGAATTCTTTGGTCAATGTTTATGCAAAATGTGGGAGCGCTAACTACGCATGTAAGGTGTTTGGGGAAATACCTGAACGAGATGTTGTGTCCTGGACGGCTTTGATTACGGGGTTTGTTGCTGAAGGATATGGAAGTGGTGCTGTTAATTTGTTTTGTGAGATGCGGAGGGAAGGTGTTGAGGCAAATGAGTTCACCTATGCGACTGCTTTGAAAGCTTGCTCCATGTGCTTGGATTTAGAGTTTGGGAAACAAGTGCATGCAGAAGCTATTAAGGTTGGAGATTTTTCTGATTTATTTGTTGGGTCTGCTCTTGTTGACCTTTATGCAAAATGTGGTGAGATGGTGCTTGCAGAGAGAGTCTTCTTGTGCATGCCCAAGCAGAATGCTGTGTCATGGAATGCATTGCTTAATGGGTTTGCACAGATGGGTGATGCTGAAAAGGTTTTGAATTTGTTTTGCAGAATGACAGGATCAGAAATAAACTTCAGCAAGTTTACTTTGTCTACTGTCCTCAAGGGTTGTGCAAACTCAGGAAATTTAAGGGCAGGCCAAATCGTGCATTCTTTGGCAATCAGGATTGGTTGTGAGCTTGATGAGTTTATTAGTTGTTGTCTTGTTGATATGTACTCCAAGTGCGGGCTGGCAGGTGATGCACTAAAAGTTTTTGTGAGGATTGAAGATCCTGATGTTGTATCCTGGAGTGCAATTATCACATGCCTTGATCAAAAAGGGCAGAGCAGAGAAGCAGCTGAGGTATTTAAAAGAATGAGACACTCAGGTGTGATACCAAACCAGTTTACCCTTGCTAGTCTTGTCAGTGCTGCCACTGATTTGGGTGACCTATATTATGGTGAAAGCATCCATGCTTGTGTTTGCAAGTATGGTTTTGAATATGATAATACGGTTTGCAATGCCTTGGTCACAATGTATATGAAAATTGGTTCTGTTCAAGATGGTTGCCGGGTGTTTGAAGCGACAACTAATCGGGATTTAATTTCATGGAATGCCCTCTTATCTGGATTCCATGACAATGAAACTTGTGATACAGGGCTAAGGATCTTCAACCAGATGCTTGCGGAGGGTTTCAACCCAAACATGTACACATTTATCAGCATTCTAAGATCTTGTTCCAGCCTTTCAGATGTAGACCTTGGGAAGCAAGTGCATGCCCAAATAGTAAAGAACAGTCTTGATGGTAATGATTTTGTTGGAACAGCTCTGGTTGATATGTATGCCAAAAACAGGTTCTTGGAAGACGCAGAAACAATTTTTAACAGATTGATTAAAAGAGACCTCTTTGCTTGGACTGTGATTGTTGCTGGTTATGCACAGGATGGCCAAGGGGAGAAGGCTGTGAAGTGTTTCATTCAAATGCAACGAGAAGGTGTGAAGCCCAATGAGTTCACACTTGCCAGCTCTTTGAGTGGTTGCTCCCGTATTGCAACTCTAGATAGTGGGCGGCAACTCCATTCCATGGCAATTAAGGCTGGGCAGTCAGGTGATATGTTTGTTGCTAGTGCTCTTGTTGATATGTATGCGAAATGTGGGTGCGTAGAAGATGCTGAGGTTGTTTTTGATGGCTTGGTTTCACGGGATACAGTCTCATGGAACACGATCATTTGTGGATACTCACAACATGGGCAAGGAGGGAAGGCTCTCAAAGCCTTTGAGGCTATGTTAGATGAGGGCACTGTGCCTGACGAGGTTACCTTCATAGGTGTTCTTTCTGCATGTAGCCATATGGGTTTAATTGAAGAAGGGAAGAAGCATTTTAATTCATTGAGCAAAATCTATGGAATCACTCCTACTATTGAGCATTATGCTTGTATGGTTGATATCCTTGGAAGGGCAGGAAAATTTCATGAGGTTGAAAGCTTTATTGAGGAGATGAAGCTAACTTCAAATGTCTTGATCTGGGAGACTGTTCTTGGAGCTTGTAAAATGCATGGAAACATAGAATTTGGTGAAAGAGCTGCAATGAAACTTTTTGAGCTTGAGCCTGAGATAGACTCAAATTATATACTACTATCTAATATGTTTGCAGCCAAAGGTATGTGGGATGATGTTACAAATGTTAGGGCATTGATGTCCACTCGGGGGGTTAAAAAGGAACCTGGATGCAGCTGGGTTGAGGTCAATGGTCAAGTCCATGTCTTTTTGTCTCATGATGGTTCACATCCAAAAATTAGGGAAATCCATCTAAAGTTACAGGATCTACACCAGAAACTGATGTCAGTTGGCTATACTCCAAACACGGACCATGTGCTTCATAATGTCTCCGACAGAGAAAAACAGGAACTCCTCTTTTATCATAGTGAAAGATTGGCTCTTGCCTTTGCTCTTCTAAGCACCAGCACCAGGAAAACTATTAGGATTTTCAAGAACCTCCGCATCTGTGGTGACTGCCATGATTTTATGAAGTCCATTTCAGAAATTACAAACCAAGAATTAGTTGTTCGTGACATTAATTGTTTTCACCACTTCAAGAATGGCTCTTGCTCTTGTCAGAATTTTTGGTGA
Protein:  
MECDCFSLRMRSPPPSFRGIFFLPSCPIQSPSLKFFKKPQTISRNFQFSIRLKSLSCALDAIESNPTGHWAFGDAQNLPVRLQDGFQKTPSKLSSPNRPNSTPGNKIPETVEKKRIWRGLDFDSKGRLRQYSGMLRTCASKGDLNEGKAIHGQVIKSGINPDSHLWNSLVNVYAKCGSANYACKVFGEIPERDVVSWTALITGFVAEGYGSGAVNLFCEMRREGVEANEFTYATALKACSMCLDLEFGKQVHAEAIKVGDFSDLFVGSALVDLYAKCGEMVLAERVFLCMPKQNAVSWNALLNGFAQMGDAEKVLNLFCRMTGSEINFSKFTLSTVLKGCANSGNLRAGQIVHSLAIRIGCELDEFISCCLVDMYSKCGLAGDALKVFVRIEDPDVVSWSAIITCLDQKGQSREAAEVFKRMRHSGVIPNQFTLASLVSAATDLGDLYYGESIHACVCKYGFEYDNTVCNALVTMYMKIGSVQDGCRVFEATTNRDLISWNALLSGFHDNETCDTGLRIFNQMLAEGFNPNMYTFISILRSCSSLSDVDLGKQVHAQIVKNSLDGNDFVGTALVDMYAKNRFLEDAETIFNRLIKRDLFAWTVIVAGYAQDGQGEKAVKCFIQMQREGVKPNEFTLASSLSGCSRIATLDSGRQLHSMAIKAGQSGDMFVASALVDMYAKCGCVEDAEVVFDGLVSRDTVSWNTIICGYSQHGQGGKALKAFEAMLDEGTVPDEVTFIGVLSACSHMGLIEEGKKHFNSLSKIYGITPTIEHYACMVDILGRAGKFHEVESFIEEMKLTSNVLIWETVLGACKMHGNIEFGERAAMKLFELEPEIDSNYILLSNMFAAKGMWDDVTNVRALMSTRGVKKEPGCSWVEVNGQVHVFLSHDGSHPKIREIHLKLQDLHQKLMSVGYTPNTDHVLHNVSDREKQELLFYHSERLALAFALLSTSTRKTIRIFKNLRICGDCHDFMKSISEITNQELVVRDINCFHHFKNGSCSCQNFW